元代管理宗教事务和西藏军事民政的中央机关。元朝初建，一切建制沿袭唐宋，根据实际需要，亦增设一些新机构，宣政院即是其一，主掌宗教和少数民族事务。由于元朝统治者崇信喇嘛教，大力推行宗教，因此主管宗教事务的宣政院权势极大，宣政院下设院使、同知、副使等官。宣政院初名总制院，设置于元世祖至元元年（1264年），至元二十五年改为宣政院。宣政院官职人选僧俗并用。遇地方有事，则设行宣政院驻当地处理。凡重大军政问题，均与枢密院共同决定。